机动车灭失证明当然是要去车管所办理的：
1、机动车灭失的，车主应当向登记地车辆管理机构申请注销登记；
2、申请时填写《申请表》，提交机动车登记证、机动车行驶证、车主身份证明、机动车灭失证明；
3、资料齐全后就可以去办理注销登记了，这个还是比较简单的。