科目三补考费是在预约的时候给的：
1、申请人申请机动车驾驶证科目三预约成功考试不合格的，申请人需要先向车管所缴纳补考费；
2、在驾驶技能准考证明有效期内，科目二和科目三道路驾驶技能考试预约考试的次数不得超过五次；
3、第五次预约考试仍不合格的，已考试合格的其他科目成绩作废。