启停系统不工作原因有：
1、在坡道上临时停车，启停系统起动较慢，容易在松开刹车时，发生车辆滑动导致危险发生；
2、大部分带有启停系统的车在发动机熄灭时，空调只会送风并不会制冷，大大影响乘坐舒适性；
3、车辆涉水过程中停下，发动机熄火，此时排气压力突然减少。水很容易从排气管倒流进入发动机内，导致发动机无法启动；